Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SNRPFP62306 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SNRPFP62306 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNRPFP62306 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms