Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.51■■□□□ 1.84
SNAP25P60880 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SNAP25P60880 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SNAP25P60880 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SNAP25P60880 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms