Protein–RNA interactions for Protein: P55160

NCKAP1L, Nck-associated protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKAP1LP55160 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCKAP1LP55160 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCKAP1LP55160 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCKAP1LP55160 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCKAP1LP55160 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCKAP1LP55160 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCKAP1LP55160 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCKAP1LP55160 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCKAP1LP55160 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NCKAP1LP55160 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NCKAP1LP55160 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NCKAP1LP55160 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NCKAP1LP55160 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NCKAP1LP55160 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NCKAP1LP55160 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms