Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPHB4P54760 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPHB4P54760 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EPHB4P54760 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EPHB4P54760 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EPHB4P54760 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
EPHB4P54760 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EPHB4P54760 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EPHB4P54760 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPHB4P54760 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms