Protein–RNA interactions for Protein: P53847

DSL1, Protein transport protein DSL1, yeast

Predictions only

Length 754 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DSL1	P53847	ESF1	YDR365C	1887 nt		5.03	□□□□□ -1.6
DSL1	P53847	ICE2	YIL090W	1476 nt		5.02	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	YDL124W	YDL124W	939 nt		5.02	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	CNL1	YDR357C	369 nt		5.02	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	CAD1	YDR423C	1230 nt		5.02	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	RPL28	YGL103W	450 nt		5.02	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	YHL049C	YHL049C	816 nt		5.02	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	PRP45	YAL032C	1140 nt		5.02	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	DSE3	YOR264W	1293 nt		5.02	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	OPY2	YPR075C	1083 nt		5.02	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	YJL206C	YJL206C	2277 nt		5.02	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	ATG20	YDL113C	1923 nt		5.01	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	RSM10	YDR041W	612 nt		5.01	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	CSL4	YNL232W	879 nt		5.01	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	NAT5	YOR253W	531 nt		5.01	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	ARR3	YPR201W	1215 nt		5.01	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	CDC28	YBR160W	897 nt		5.01	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	NNK1	YKL171W	2787 nt		5.01	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	AXL2	YIL140W	2472 nt		5.01	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	CRT10	YOL063C	2874 nt		5.01	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	UTR4	YEL038W	684 nt		5	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	LST8	YNL006W	912 nt		5	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	SMA1	YPL027W	738 nt		5	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	YPL113C	YPL113C	1191 nt		5	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	YCL021W-A	YCL021W-A	378 nt		5	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	HXT14	YNL318C	1623 nt		5	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	TOS4	YLR183C	1470 nt		5	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	THI20	YOL055C	1656 nt		4.99	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	IMG2	YCR071C	441 nt		4.99	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	ASP1	YDR321W	1146 nt		4.99	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	ACT1	YFL039C	1128 nt		4.99	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	MMS2	YGL087C	414 nt		4.99	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	SUA5	YGL169W	1281 nt		4.99	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	SKI6	YGR195W	741 nt		4.99	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	COS9	YKL219W	1224 nt		4.99	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	YOL097W-A	YOL097W-A	186 nt		4.99	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	snR19	snR19	568 nt		4.99	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	MRPL36	YBR122C	534 nt		4.99	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	YBR230W-A	YBR230W-A	201 nt		4.99	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	PCL8	YPL219W	1479 nt		4.99	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	TRM44	YPL030W	1704 nt		4.98	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	RMR1	YGL250W	726 nt		4.98	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	YGR269W	YGR269W	327 nt		4.98	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	CBC2	YPL178W	627 nt		4.98	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	snR17b	snR17b	332 nt		4.98	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	SBE2	YDR351W	2595 nt		4.98	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	HUL4	YJR036C	2679 nt		4.98	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	ORC6	YHR118C	1308 nt		4.97	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	PGM2	YMR105C	1710 nt		4.97	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	YGR022C	YGR022C	330 nt		4.97	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	CBP4	YGR174C	513 nt		4.97	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	OSW5	YMR148W	447 nt		4.97	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	NOP13	YNL175C	1212 nt		4.97	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	YPL014W	YPL014W	1146 nt		4.97	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	DCC1	YCL016C	1143 nt		4.97	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	FRE7	YOL152W	1863 nt		4.96	□□□□□ -1.61
DSL1	P53847	RKM4	YDR257C	1485 nt		4.96	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	GIR2	YDR152W	798 nt		4.96	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	AAD6	YFL056C	639 nt		4.96	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	YPT32	YGL210W	669 nt		4.96	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	IMP2	YMR035W	534 nt		4.96	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	ADD37	YMR184W	597 nt		4.96	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	SHP1	YBL058W	1272 nt		4.96	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	YNR075C-A	YNR075C-A	93 nt		4.96	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	CAR1	YPL111W	1002 nt		4.96	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	MMT2	YPL224C	1455 nt		4.95	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	SLD2	YKL108W	1362 nt		4.95	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	MAC1	YMR021C	1254 nt		4.95	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	COG5	YNL051W	1212 nt		4.95	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	MRPL22	YNL177C	930 nt		4.95	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	RPL21B	YPL079W	483 nt		4.95	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	ALD3	YMR169C	1521 nt		4.95	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	ALD2	YMR170C	1521 nt		4.95	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	ATG32	YIL146C	1590 nt		4.95	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	GDE1	YPL110C	3672 nt		4.94	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	STB2	YMR053C	2553 nt		4.94	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	TIF4632	YGL049C	2745 nt		4.94	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	LHP1	YDL051W	828 nt		4.94	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	YEL028W	YEL028W	462 nt		4.94	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	SPL2	YHR136C	447 nt		4.94	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	YKR075C	YKR075C	924 nt		4.94	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	DAL82	YNL314W	768 nt		4.94	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	QCR2	YPR191W	1107 nt		4.94	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	KRE6	YPR159W	2163 nt		4.94	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	GCR2	YNL199C	1605 nt		4.94	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	PAN1	YIR006C	4443 nt		4.93	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	CDC19	YAL038W	1503 nt		4.93	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	LCB2	YDR062W	1686 nt		4.93	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	VID30	YGL227W	2877 nt		4.93	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	MSH1	YHR120W	2880 nt		4.93	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	HPM1	YIL110W	1134 nt		4.93	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	CPR6	YLR216C	1116 nt		4.93	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	SPO77	YLR341W	1434 nt		4.93	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	YCL012C	YCL012C	405 nt		4.93	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	PRP28	YDR243C	1767 nt		4.93	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	YJR124C	YJR124C	1347 nt		4.93	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	UBX7	YBR273C	1311 nt		4.93	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	RTT106	YNL206C	1368 nt		4.92	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	AVT3	YKL146W	2079 nt		4.92	□□□□□ -1.62
DSL1	P53847	STR2	YJR130C	1920 nt		4.92	□□□□□ -1.62

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