Protein–RNA interactions for Protein: P51681

CCR5, C-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR5P51681 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR5P51681 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR5P51681 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR5P51681 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR5P51681 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR5P51681 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR5P51681 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR5P51681 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCR5P51681 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR5P51681 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR5P51681 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR5P51681 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR5P51681 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR5P51681 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR5P51681 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR5P51681 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR5P51681 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR5P51681 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR5P51681 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR5P51681 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR5P51681 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR5P51681 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR5P51681 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR5P51681 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCR5P51681 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR5P51681 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR5P51681 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR5P51681 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR5P51681 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR5P51681 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR5P51681 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR5P51681 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR5P51681 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR5P51681 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR5P51681 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCR5P51681 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR5P51681 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR5P51681 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR5P51681 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR5P51681 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR5P51681 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR5P51681 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR5P51681 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR5P51681 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR5P51681 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR5P51681 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR5P51681 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR5P51681 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR5P51681 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR5P51681 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCR5P51681 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR5P51681 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR5P51681 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR5P51681 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR5P51681 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR5P51681 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR5P51681 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCR5P51681 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR5P51681 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR5P51681 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR5P51681 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR5P51681 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR5P51681 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR5P51681 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR5P51681 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR5P51681 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR5P51681 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR5P51681 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR5P51681 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR5P51681 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR5P51681 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCR5P51681 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR5P51681 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR5P51681 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR5P51681 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR5P51681 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR5P51681 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR5P51681 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR5P51681 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR5P51681 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR5P51681 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR5P51681 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR5P51681 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR5P51681 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR5P51681 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR5P51681 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCR5P51681 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR5P51681 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR5P51681 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR5P51681 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR5P51681 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR5P51681 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR5P51681 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR5P51681 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR5P51681 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR5P51681 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR5P51681 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCR5P51681 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCR5P51681 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCR5P51681 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms