Protein–RNA interactions for Protein: P47804

RGR, RPE-retinal G protein-coupled receptor, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGRP47804 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGRP47804 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGRP47804 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGRP47804 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGRP47804 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGRP47804 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGRP47804 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGRP47804 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RGRP47804 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGRP47804 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGRP47804 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGRP47804 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGRP47804 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGRP47804 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGRP47804 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGRP47804 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGRP47804 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGRP47804 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RGRP47804 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGRP47804 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGRP47804 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGRP47804 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGRP47804 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGRP47804 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGRP47804 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGRP47804 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGRP47804 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGRP47804 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGRP47804 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGRP47804 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RGRP47804 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGRP47804 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGRP47804 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGRP47804 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGRP47804 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGRP47804 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGRP47804 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGRP47804 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RGRP47804 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RGRP47804 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGRP47804 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGRP47804 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGRP47804 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGRP47804 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGRP47804 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGRP47804 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RGRP47804 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RGRP47804 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGRP47804 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGRP47804 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGRP47804 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGRP47804 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGRP47804 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RGRP47804 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RGRP47804 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RGRP47804 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RGRP47804 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGRP47804 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGRP47804 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RGRP47804 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RGRP47804 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGRP47804 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGRP47804 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGRP47804 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGRP47804 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGRP47804 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGRP47804 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGRP47804 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGRP47804 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGRP47804 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGRP47804 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGRP47804 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGRP47804 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RGRP47804 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGRP47804 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGRP47804 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGRP47804 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGRP47804 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGRP47804 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGRP47804 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGRP47804 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RGRP47804 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGRP47804 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGRP47804 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGRP47804 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGRP47804 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGRP47804 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RGRP47804 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGRP47804 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGRP47804 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGRP47804 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGRP47804 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGRP47804 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGRP47804 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGRP47804 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGRP47804 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGRP47804 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGRP47804 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGRP47804 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RGRP47804 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms