Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
GNPDA1P46926 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GNPDA1P46926 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GNPDA1P46926 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms