Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cdh15P33146 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cdh15P33146 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms