Protein–RNA interactions for Protein: P27694

RPA1, Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA1P27694 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPA1P27694 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPA1P27694 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPA1P27694 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPA1P27694 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPA1P27694 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPA1P27694 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RPA1P27694 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPA1P27694 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPA1P27694 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPA1P27694 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPA1P27694 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPA1P27694 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPA1P27694 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPA1P27694 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RPA1P27694 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RPA1P27694 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPA1P27694 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RPA1P27694 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPA1P27694 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPA1P27694 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPA1P27694 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPA1P27694 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPA1P27694 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPA1P27694 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPA1P27694 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPA1P27694 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPA1P27694 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPA1P27694 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPA1P27694 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPA1P27694 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPA1P27694 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPA1P27694 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPA1P27694 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPA1P27694 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPA1P27694 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPA1P27694 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPA1P27694 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPA1P27694 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPA1P27694 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPA1P27694 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPA1P27694 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPA1P27694 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPA1P27694 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPA1P27694 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPA1P27694 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPA1P27694 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPA1P27694 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPA1P27694 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPA1P27694 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPA1P27694 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPA1P27694 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPA1P27694 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPA1P27694 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPA1P27694 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RPA1P27694 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RPA1P27694 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RPA1P27694 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPA1P27694 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPA1P27694 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPA1P27694 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPA1P27694 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
RPA1P27694 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPA1P27694 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPA1P27694 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPA1P27694 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPA1P27694 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPA1P27694 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPA1P27694 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPA1P27694 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPA1P27694 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RPA1P27694 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPA1P27694 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPA1P27694 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPA1P27694 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPA1P27694 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPA1P27694 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPA1P27694 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPA1P27694 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPA1P27694 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPA1P27694 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPA1P27694 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPA1P27694 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPA1P27694 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPA1P27694 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPA1P27694 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPA1P27694 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPA1P27694 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPA1P27694 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPA1P27694 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPA1P27694 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPA1P27694 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPA1P27694 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPA1P27694 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPA1P27694 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPA1P27694 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPA1P27694 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RPA1P27694 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPA1P27694 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RPA1P27694 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms