Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRBP23467 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PTPRBP23467 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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