Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLDCP23378 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLDCP23378 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLDCP23378 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLDCP23378 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLDCP23378 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLDCP23378 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLDCP23378 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLDCP23378 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLDCP23378 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GLDCP23378 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLDCP23378 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLDCP23378 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLDCP23378 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLDCP23378 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLDCP23378 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GLDCP23378 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLDCP23378 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLDCP23378 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLDCP23378 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLDCP23378 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLDCP23378 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLDCP23378 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLDCP23378 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLDCP23378 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLDCP23378 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLDCP23378 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GLDCP23378 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GLDCP23378 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLDCP23378 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLDCP23378 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLDCP23378 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLDCP23378 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLDCP23378 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLDCP23378 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLDCP23378 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLDCP23378 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLDCP23378 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLDCP23378 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLDCP23378 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLDCP23378 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLDCP23378 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLDCP23378 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLDCP23378 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLDCP23378 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GLDCP23378 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLDCP23378 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLDCP23378 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLDCP23378 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLDCP23378 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLDCP23378 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLDCP23378 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLDCP23378 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLDCP23378 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLDCP23378 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLDCP23378 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GLDCP23378 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GLDCP23378 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GLDCP23378 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
GLDCP23378 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLDCP23378 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLDCP23378 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLDCP23378 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLDCP23378 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLDCP23378 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLDCP23378 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GLDCP23378 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GLDCP23378 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLDCP23378 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLDCP23378 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GLDCP23378 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLDCP23378 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GLDCP23378 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GLDCP23378 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GLDCP23378 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GLDCP23378 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GLDCP23378 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLDCP23378 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLDCP23378 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLDCP23378 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GLDCP23378 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLDCP23378 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLDCP23378 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GLDCP23378 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLDCP23378 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLDCP23378 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GLDCP23378 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLDCP23378 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLDCP23378 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLDCP23378 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLDCP23378 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLDCP23378 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLDCP23378 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLDCP23378 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GLDCP23378 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLDCP23378 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLDCP23378 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLDCP23378 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GLDCP23378 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GLDCP23378 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms