Protein–RNA interactions for Protein: P17677

GAP43, Neuromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAP43P17677 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GAP43P17677 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GAP43P17677 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GAP43P17677 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GAP43P17677 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GAP43P17677 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GAP43P17677 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GAP43P17677 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GAP43P17677 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GAP43P17677 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GAP43P17677 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GAP43P17677 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GAP43P17677 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAP43P17677 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAP43P17677 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAP43P17677 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAP43P17677 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAP43P17677 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GAP43P17677 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAP43P17677 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAP43P17677 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAP43P17677 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAP43P17677 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAP43P17677 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAP43P17677 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAP43P17677 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAP43P17677 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAP43P17677 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAP43P17677 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAP43P17677 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAP43P17677 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAP43P17677 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAP43P17677 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAP43P17677 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAP43P17677 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAP43P17677 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAP43P17677 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAP43P17677 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GAP43P17677 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GAP43P17677 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GAP43P17677 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GAP43P17677 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GAP43P17677 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GAP43P17677 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GAP43P17677 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GAP43P17677 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GAP43P17677 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GAP43P17677 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GAP43P17677 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GAP43P17677 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GAP43P17677 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GAP43P17677 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GAP43P17677 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GAP43P17677 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GAP43P17677 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GAP43P17677 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GAP43P17677 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAP43P17677 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAP43P17677 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAP43P17677 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAP43P17677 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAP43P17677 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAP43P17677 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAP43P17677 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAP43P17677 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAP43P17677 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAP43P17677 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAP43P17677 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GAP43P17677 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GAP43P17677 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GAP43P17677 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GAP43P17677 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GAP43P17677 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GAP43P17677 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GAP43P17677 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GAP43P17677 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GAP43P17677 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GAP43P17677 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GAP43P17677 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GAP43P17677 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GAP43P17677 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GAP43P17677 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GAP43P17677 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GAP43P17677 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAP43P17677 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAP43P17677 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GAP43P17677 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAP43P17677 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAP43P17677 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAP43P17677 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAP43P17677 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAP43P17677 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAP43P17677 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAP43P17677 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GAP43P17677 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GAP43P17677 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GAP43P17677 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GAP43P17677 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GAP43P17677 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GAP43P17677 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms