Protein–RNA interactions for Protein: P13637

ATP1A3, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A3P13637 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATP1A3P13637 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP1A3P13637 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP1A3P13637 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms