Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
LAMC1P11047 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC32.76■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.73■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
LAMC1P11047 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
LAMC1P11047 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms