Protein–RNA interactions for Protein: P01854

IGHE, Immunoglobulin heavy constant epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHEP01854 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHEP01854 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHEP01854 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHEP01854 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHEP01854 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHEP01854 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IGHEP01854 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHEP01854 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHEP01854 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHEP01854 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHEP01854 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHEP01854 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHEP01854 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHEP01854 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IGHEP01854 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHEP01854 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHEP01854 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHEP01854 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHEP01854 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHEP01854 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHEP01854 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHEP01854 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHEP01854 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHEP01854 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHEP01854 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IGHEP01854 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHEP01854 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHEP01854 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHEP01854 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHEP01854 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IGHEP01854 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IGHEP01854 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IGHEP01854 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IGHEP01854 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IGHEP01854 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IGHEP01854 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
IGHEP01854 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHEP01854 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
IGHEP01854 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHEP01854 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHEP01854 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHEP01854 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHEP01854 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IGHEP01854 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGHEP01854 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGHEP01854 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
IGHEP01854 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IGHEP01854 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IGHEP01854 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IGHEP01854 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IGHEP01854 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IGHEP01854 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
IGHEP01854 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IGHEP01854 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGHEP01854 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGHEP01854 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IGHEP01854 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
IGHEP01854 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IGHEP01854 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
IGHEP01854 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.3■■□□□ 1
IGHEP01854 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGHEP01854 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IGHEP01854 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGHEP01854 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGHEP01854 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGHEP01854 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGHEP01854 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGHEP01854 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGHEP01854 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGHEP01854 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IGHEP01854 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGHEP01854 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGHEP01854 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IGHEP01854 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IGHEP01854 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
IGHEP01854 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IGHEP01854 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGHEP01854 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IGHEP01854 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGHEP01854 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IGHEP01854 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IGHEP01854 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGHEP01854 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGHEP01854 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGHEP01854 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IGHEP01854 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
IGHEP01854 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IGHEP01854 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.28■■□□□ 1
IGHEP01854 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IGHEP01854 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IGHEP01854 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGHEP01854 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGHEP01854 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGHEP01854 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IGHEP01854 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IGHEP01854 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IGHEP01854 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGHEP01854 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
IGHEP01854 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IGHEP01854 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms