Protein–RNA interactions for Protein: O75962

TRIO, Triple functional domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,097 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOO75962 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIOO75962 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIOO75962 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIOO75962 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIOO75962 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIOO75962 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIOO75962 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIOO75962 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIOO75962 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIOO75962 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIOO75962 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIOO75962 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIOO75962 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIOO75962 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIOO75962 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIOO75962 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIOO75962 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIOO75962 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIOO75962 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIOO75962 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIOO75962 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIOO75962 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIOO75962 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIOO75962 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIOO75962 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIOO75962 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIOO75962 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIOO75962 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIOO75962 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIOO75962 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIOO75962 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIOO75962 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIOO75962 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIOO75962 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIOO75962 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIOO75962 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIOO75962 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIOO75962 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIOO75962 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIOO75962 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIOO75962 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIOO75962 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIOO75962 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIOO75962 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIOO75962 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIOO75962 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIOO75962 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIOO75962 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIOO75962 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIOO75962 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIOO75962 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIOO75962 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIOO75962 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIOO75962 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIOO75962 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIOO75962 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIOO75962 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIOO75962 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIOO75962 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIOO75962 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIOO75962 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIOO75962 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIOO75962 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIOO75962 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIOO75962 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIOO75962 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIOO75962 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIOO75962 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIOO75962 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIOO75962 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIOO75962 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIOO75962 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIOO75962 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIOO75962 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIOO75962 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIOO75962 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIOO75962 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIOO75962 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIOO75962 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIOO75962 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIOO75962 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIOO75962 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRIOO75962 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIOO75962 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIOO75962 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIOO75962 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIOO75962 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIOO75962 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TRIOO75962 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIOO75962 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIOO75962 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIOO75962 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIOO75962 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIOO75962 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIOO75962 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRIOO75962 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIOO75962 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIOO75962 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIOO75962 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRIOO75962 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms