Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
DCTN3O75935 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DCTN3O75935 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DCTN3O75935 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms