Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EXTL3O43909 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EXTL3O43909 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms