Protein–RNA interactions for Protein: O43508

TNFSF12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF12O43508 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TNFSF12O43508 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TNFSF12O43508 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms