Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 GALK2-203ENST00000544523 1950 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.164e-7■■■■■ 33.1
RBFOX2O43251 GALK2-204ENST00000558145 567 ntTSL 47.31□□□□□ -1.244e-7■■■■■ 33.1
RBFOX2O43251 GALK2-218ENST00000560138 722 ntTSL 56.8□□□□□ -1.324e-7■■■■■ 33.1
RBFOX2O43251 GALK2-214ENST00000559883 991 ntTSL 46.75□□□□□ -1.334e-7■■■■■ 33.1
RBFOX2O43251 GALK2-206ENST00000558775 813 ntTSL 36.75□□□□□ -1.334e-7■■■■■ 33.1
RBFOX2O43251 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.394e-7■■■■■ 33.1
RBFOX2O43251 GALK2-210ENST00000559208 861 ntTSL 56.01□□□□□ -1.454e-7■■■■■ 33.1
RBFOX2O43251 GALK2-207ENST00000558956 641 ntTSL 55.9□□□□□ -1.464e-7■■■■■ 33.1
RBFOX2O43251 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.11e-12■■■■■ 33
RBFOX2O43251 TCTA-203ENST00000487432 892 ntTSL 214.26□□□□□ -0.131e-12■■■■■ 33
RBFOX2O43251 TCTA-205ENST00000493381 1081 ntTSL 313.8□□□□□ -0.21e-12■■■■■ 33
RBFOX2O43251 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.439e-9■■■■■ 33
RBFOX2O43251 PDE4D-206ENST00000405053 512 ntTSL 58.69□□□□□ -1.029e-9■■■■■ 33
RBFOX2O43251 PDE4D-208ENST00000502484 2478 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.339e-9■■■■■ 33
RBFOX2O43251 PDE4D-221ENST00000514231 733 ntTSL 32.33□□□□□ -2.049e-9■■■■■ 33
RBFOX2O43251 MAGI1-208ENST00000472257 3045 ntTSL 512.58□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 33
RBFOX2O43251 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.391e-9■■■■■ 33
RBFOX2O43251 PFKL-206ENST00000467315 1947 ntTSL 215.86■□□□□ 0.134e-12■■■■■ 33
RBFOX2O43251 PFKL-204ENST00000460521 2818 ntTSL 211.81□□□□□ -0.524e-12■■■■■ 33
RBFOX2O43251 BTG2-202ENST00000475157 1275 ntTSL 511.65□□□□□ -0.542e-6■■■■■ 32.9
RBFOX2O43251 BTG2-201ENST00000290551 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.852e-6■■■■■ 32.9
RBFOX2O43251 POLR3E-217ENST00000569757 662 ntTSL 412.61□□□□□ -0.393e-18■■■■■ 32.9
RBFOX2O43251 POLR3E-215ENST00000565551 645 ntTSL 511.94□□□□□ -0.53e-18■■■■■ 32.9
RBFOX2O43251 MYO9A-201ENST00000356056 12411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.931e-6■■■■■ 32.9
RBFOX2O43251 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.691e-6■■■■■ 32.9
RBFOX2O43251 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.26□□□□□ -1.731e-6■■■■■ 32.9
RBFOX2O43251 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.436e-8■■■■■ 32.8
RBFOX2O43251 AKT1-216ENST00000556836 592 ntTSL 414.32□□□□□ -0.121e-10■■■■■ 32.8
RBFOX2O43251 AARS-207ENST00000569825 871 ntTSL 213.7□□□□□ -0.225e-12■■■■■ 32.8
RBFOX2O43251 AARS-201ENST00000261772 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.835e-12■■■■■ 32.8
RBFOX2O43251 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.432e-8■■■■■ 32.8
RBFOX2O43251 GPI-208ENST00000588991 2021 ntTSL 216.96■□□□□ 0.32e-8■■■■■ 32.8
RBFOX2O43251 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.362e-8■■■■■ 32.8
RBFOX2O43251 GPI-202ENST00000415930 4000 ntTSL 2 BASIC6.42□□□□□ -1.382e-8■■■■■ 32.8
RBFOX2O43251 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.183e-8■■■■■ 32.8
RBFOX2O43251 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.563e-8■■■■■ 32.8
RBFOX2O43251 PFKP-205ENST00000413079 496 ntTSL 310.77□□□□□ -0.691e-8■■■■■ 32.8
RBFOX2O43251 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.145e-7■■■■■ 32.8
RBFOX2O43251 ZNF148-204ENST00000471196 566 ntTSL 415.46■□□□□ 0.075e-7■■■■■ 32.8
RBFOX2O43251 ZNF148-205ENST00000484491 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.675e-7■■■■■ 32.8
RBFOX2O43251 ZNF148-206ENST00000485866 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.685e-7■■■■■ 32.8
RBFOX2O43251 ZNF148-207ENST00000492394 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.015e-7■■■■■ 32.8
RBFOX2O43251 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.45e-7■■■■■ 32.8
RBFOX2O43251 HIVEP2-203ENST00000367604 10032 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.941e-8■■■■■ 32.7
RBFOX2O43251 HIVEP2-202ENST00000367603 9724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.191e-8■■■■■ 32.7
RBFOX2O43251 LEO1-202ENST00000315141 1981 ntTSL 2 BASIC7.89□□□□□ -1.151e-6■■■■■ 32.7
RBFOX2O43251 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.381e-6■■■■■ 32.7
RBFOX2O43251 FUS-213ENST00000570090 544 ntTSL 213.22□□□□□ -0.295e-17■■■■■ 32.7
RBFOX2O43251 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.292e-7■■■■■ 32.6
RBFOX2O43251 MGAT4B-221ENST00000523108 1080 ntTSL 516.67■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 32.6
RBFOX2O43251 MGAT4B-209ENST00000519836 1686 ntTSL 1 (best)16.08■□□□□ 0.162e-7■■■■■ 32.6
RBFOX2O43251 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 32.6
RBFOX2O43251 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.019e-7■■■■■ 32.6
RBFOX2O43251 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.029e-7■■■■■ 32.6
RBFOX2O43251 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.279e-7■■■■■ 32.6
RBFOX2O43251 ASXL1-201ENST00000306058 6591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.569e-7■■■■■ 32.6
RBFOX2O43251 ASXL1-204ENST00000470145 1073 ntTSL 58.05□□□□□ -1.129e-7■■■■■ 32.6
RBFOX2O43251 PLEKHA1-202ENST00000368989 3771 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -18e-9■■■■■ 32.6
RBFOX2O43251 PLEKHA1-204ENST00000392799 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.448e-9■■■■■ 32.6
RBFOX2O43251 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.548e-9■■■■■ 32.6
RBFOX2O43251 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.588e-9■■■■■ 32.6
RBFOX2O43251 PLEKHA1-205ENST00000433307 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.598e-9■■■■■ 32.6
RBFOX2O43251 KCNH2-204ENST00000461280 2430 ntTSL 1 (best)15.95■□□□□ 0.146e-7■■■■■ 32.6
RBFOX2O43251 KCNH2-205ENST00000473610 2782 ntTSL 215.14■□□□□ 0.016e-7■■■■■ 32.6
RBFOX2O43251 KCNH2-206ENST00000532957 3374 ntTSL 215.06■□□□□ 06e-7■■■■■ 32.6
RBFOX2O43251 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.016e-7■■■■■ 32.6
RBFOX2O43251 EPB41L2-225ENST00000530707 565 ntTSL 410.31□□□□□ -0.761e-7■■■■■ 32.6
RBFOX2O43251 EPB41L2-212ENST00000526333 549 ntTSL 55.26□□□□□ -1.571e-7■■■■■ 32.6
RBFOX2O43251 EPB41L2-219ENST00000528179 560 ntTSL 53.81□□□□□ -1.81e-7■■■■■ 32.6
RBFOX2O43251 EPB41L2-222ENST00000529709 585 ntTSL 43.2□□□□□ -1.91e-7■■■■■ 32.6
RBFOX2O43251 EPB41L2-214ENST00000526983 552 ntTSL 42.43□□□□□ -2.021e-7■■■■■ 32.6
RBFOX2O43251 EPB41L2-229ENST00000532499 591 ntTSL 31.9□□□□□ -2.111e-7■■■■■ 32.6
RBFOX2O43251 DCTN1-220ENST00000477966 766 ntTSL 214.75□□□□□ -0.052e-6■■■■■ 32.5
RBFOX2O43251 DCTN1-227ENST00000633691 4160 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.922e-6■■■■■ 32.5
RBFOX2O43251 DCTN1-204ENST00000409438 4145 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.992e-6■■■■■ 32.5
RBFOX2O43251 SLC1A2-206ENST00000479543 564 ntTSL 510.62□□□□□ -0.715e-7■■■■■ 32.5
RBFOX2O43251 SLC1A2-201ENST00000278379 11696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.215e-7■■■■■ 32.5
RBFOX2O43251 SLC1A2-202ENST00000395750 11538 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.515e-7■■■■■ 32.5
RBFOX2O43251 SLC1A2-203ENST00000395753 11689 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.575e-7■■■■■ 32.5
RBFOX2O43251 SLC1A2-205ENST00000464522 607 ntTSL 33.93□□□□□ -1.785e-7■■■■■ 32.5
RBFOX2O43251 FAM126B-201ENST00000286181 4778 ntTSL 1 (best)9.27□□□□□ -0.936e-8■■■■■ 32.5
RBFOX2O43251 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.916e-8■■■■■ 32.5
RBFOX2O43251 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.943e-9■■■■■ 32.5
RBFOX2O43251 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.493e-9■■■■■ 32.5
RBFOX2O43251 MPP6-206ENST00000432190 982 ntTSL 318.05■□□□□ 0.483e-9■■■■■ 32.5
RBFOX2O43251 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.473e-9■■■■■ 32.5
RBFOX2O43251 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.253e-9■■■■■ 32.5
RBFOX2O43251 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.193e-9■■■■■ 32.5
RBFOX2O43251 CSNK1D-215ENST00000580784 1081 ntTSL 1 (best)16.15■□□□□ 0.183e-9■■■■■ 32.5
RBFOX2O43251 MPP6-205ENST00000430180 1191 ntTSL 514.72□□□□□ -0.053e-9■■■■■ 32.5
RBFOX2O43251 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.213e-9■■■■■ 32.5
RBFOX2O43251 CSNK1D-201ENST00000269361 1088 ntTSL 513.18□□□□□ -0.33e-9■■■■■ 32.5
RBFOX2O43251 CSNK1D-205ENST00000403276 1040 ntTSL 212.85□□□□□ -0.353e-9■■■■■ 32.5
RBFOX2O43251 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.363e-9■■■■■ 32.5
RBFOX2O43251 CSNK1D-217ENST00000581241 6094 ntTSL 212.5□□□□□ -0.413e-9■■■■■ 32.5
RBFOX2O43251 NEURL4-206ENST00000571887 4291 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.05□□□□□ -0.483e-9■■■■■ 32.5
RBFOX2O43251 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.493e-9■■■■■ 32.5
RBFOX2O43251 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.583e-9■■■■■ 32.5
RBFOX2O43251 CC2D1B-203ENST00000438021 2521 ntTSL 1 (best)11□□□□□ -0.653e-9■■■■■ 32.5
RBFOX2O43251 CSNK1D-222ENST00000584377 2891 ntTSL 210.91□□□□□ -0.663e-9■■■■■ 32.5
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