Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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SH3BP1Q9Y3L3 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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SH3BP1Q9Y3L3 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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SH3BP1Q9Y3L3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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SH3BP1Q9Y3L3 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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SH3BP1Q9Y3L3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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SH3BP1Q9Y3L3 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SH3BP1Q9Y3L3 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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