Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TRAPPC8Q9Y2L5 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX3-204ENST00000426155 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TRAPPC8Q9Y2L5 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 202.3 ms