Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
APEX2Q9UBZ4 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
APEX2Q9UBZ4 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms