Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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LHX3Q9UBR4 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
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LHX3Q9UBR4 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LHX3Q9UBR4 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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