Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PPARGC1AQ9UBK2 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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