Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
FANCFQ9NPI8 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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