Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2A0

LINC00269, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00269, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00269Q8N2A0 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 RAB18-208ENST00000611151 4931 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
LINC00269Q8N2A0 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms