Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT28

FAM27B, Protein FAM27A/B/C, humanhuman

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27BQ5VT28 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
FAM27BQ5VT28 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms