Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Aamdc-203ENSMUST00000124552 618 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Snx27Q3UHD6 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 166 ms