Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AC025524.2-206ENST00000517953 439 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 TUBGCP3-201ENST00000261965 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 SUV39H2-201ENST00000313519 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ZNF331-218ENST00000513265 739 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AL356019.1-201ENST00000553419 748 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
LAPTM4AQ15012 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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