Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PCLAFQ15004 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms