Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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CDH18Q13634 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CDH18Q13634 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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