Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FOXC1Q12948 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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FOXC1Q12948 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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FOXC1Q12948 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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FOXC1Q12948 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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FOXC1Q12948 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
FOXC1Q12948 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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