Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
FOXF1Q12946 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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FOXF1Q12946 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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FOXF1Q12946 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXF1Q12946 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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