Protein–RNA interactions for Protein: P62068

USP46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, humanhuman

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Length 366 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46P62068 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 AC010181.2-201ENST00000483759 482 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
USP46P62068 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
USP46P62068 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
USP46P62068 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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