Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ERVFC1P60507 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ERVFC1P60507 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms