Protein–RNA interactions for Protein: P43681

CHRNA4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA4P43681 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CHRNA4P43681 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA4P43681 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA4P43681 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA4P43681 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA4P43681 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA4P43681 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA4P43681 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA4P43681 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA4P43681 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA4P43681 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA4P43681 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA4P43681 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA4P43681 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CHRNA4P43681 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CHRNA4P43681 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CHRNA4P43681 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms