Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA10P31260 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA10P31260 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA10P31260 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA10P31260 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA10P31260 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA10P31260 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA10P31260 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA10P31260 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA10P31260 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA10P31260 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA10P31260 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA10P31260 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA10P31260 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA10P31260 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA10P31260 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA10P31260 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA10P31260 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA10P31260 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA10P31260 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA10P31260 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA10P31260 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA10P31260 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA10P31260 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA10P31260 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HOXA10P31260 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA10P31260 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA10P31260 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA10P31260 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA10P31260 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA10P31260 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA10P31260 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA10P31260 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HOXA10P31260 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 MBD3L4-201ENST00000381394 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXA10P31260 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms