Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DPA1P20036 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DPA1P20036 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DPA1P20036 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DPA1P20036 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DPA1P20036 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DPA1P20036 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DPA1P20036 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DPA1P20036 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DPA1P20036 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DPA1P20036 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DPA1P20036 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DPA1P20036 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DPA1P20036 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DPA1P20036 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DPA1P20036 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DPA1P20036 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DPA1P20036 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HLA-DPA1P20036 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DPA1P20036 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DPA1P20036 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DPA1P20036 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DPA1P20036 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DPA1P20036 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DPA1P20036 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DPA1P20036 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HLA-DPA1P20036 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HLA-DPA1P20036 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms