Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERVW-1Q9UQF0 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms