Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SNX6Q9UNH7 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SNX6Q9UNH7 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
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SNX6Q9UNH7 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SNX6Q9UNH7 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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SNX6Q9UNH7 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SNX6Q9UNH7 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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