Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CEP44Q9C0F1 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms