Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX97

PLVAP, Plasmalemma vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLVAPQ9BX97 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PLVAPQ9BX97 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PLVAPQ9BX97 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms