Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
COG3Q96JB2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
COG3Q96JB2 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms