Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 FCRL6-202ENST00000339348 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 AL157823.1-201ENST00000403727 628 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 AL356417.1-201ENST00000421161 845 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 CES1P2-201ENST00000566467 1242 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 CNBP-205ENST00000500450 1516 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 RPL15-208ENST00000435882 1063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 AC009950.1-210ENST00000594622 553 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TOPBP1Q92547 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms