Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CUL4BQ13620 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CUL4BQ13620 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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