Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TRAF2Q12933 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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TRAF2Q12933 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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TRAF2Q12933 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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TRAF2Q12933 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TRAF2Q12933 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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TRAF2Q12933 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TRAF2Q12933 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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