Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 AL132994.1-201ENST00000554098 400 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 SULT1A1-201ENST00000314752 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 AC005154.1-232ENST00000582549 556 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 MCEMP1-202ENST00000597445 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP7AQ04656 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms