Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PLOD1Q02809 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms